1590年，科罗拉多派遣由弗纳多•德加玛将军（Miguel Martinez 饰）率领的一千人部队，进入传奇的黄金城市埃尔多拉多寻找黄金，但他们遭遇了骷髅军团的袭击，一千人无一生还。 时间推至现代，戈登教授（Miguel Martinez 饰）率领一群年轻人组织的考古队前来寻找黄金城旧址，受到三个开着越野吉普的年轻人的胁迫，考古队被迫与他们同行。几经周折，他们终于找到埋藏着皑皑白骨和黄金的山洞，这群不速之客吵醒了守卫黄金的骷髅军团，一场古代对现代、骷髅对人类的战争旋即展开。
