悉尼醒来后发现自己身处香港，对过去两年的生活失去了记忆，她回到洛杉矶，试图拼凑起生命最后两年的点滴，并发现了朋友和家人的命运：沃恩以为悉尼早已死去，却结婚了；马歇尔与中情局技术专家凯莉·鲍曼怀上了孩子；迪克森现在是中情局洛杉矶分局的新部门负责人。悉尼还了解到杰克和斯隆的惊人命运；前者因与仍在躲藏的伊琳娜联络而被中情局拘留，而后者则被软禁在瑞士，以换取与中情局的合作。悉尼被中情局授予临时许可，可以处理一个可能有助于她恢复记忆的案件，并遇到了一个名为“盟约”的新敌对组织。
